ISR y su pago en franja fronteriza - contadores

Ayuda.

Si me dieron de alta en un trabajo en la franja fronteriza con el mínimo, el cual no paga ISR. En la declaración anual como se hace para aclarar este caso o que se puede hacer, ya que se está cobrando el ISR de esos meses trabajados el cual obviamente no se pagó por tener ese beneficio en la frontera.

La pregunta es, como le hago para aclarar esto ante al sat en relación a la declaración anual?